De Stichting van de Maatschappij tot exploitatie van Staatsspoorwegen was verantwoordelijk voor de aanleg van de spoorlijn Amersfoort – Kesteren, die op 16 februari 1886 officieel geopend werd. In dat jaar werd door de Staat een stuk bouwland gekocht van Aaltje van Egdom. Daarop werd een station, een loods en een woning voor de halte-chef gebouwd. De architect was M.A. van Wadenoyen.
Station Woudenberg-Scherpenzeel lag op 2 km van de oude dorpskern van Woudenberg. Niet alleen voor de inwoners van Woudenberg en Scherpenzeel, die dicht bij een station kwamen te wonen, maar ook voor de vele vaak agrarische bedrijven in de omgeving had dit grote voordelen. De Roomboterfabriek De Vooruitgang en de Coöperatieve Handelsvereniging Woudenberg -Maarn vestigden zich in de buurt van het station en maakten intensief gebruik van het spoor. De aanleg van het spoor zou later in ruimtelijke zin ook gevolgen krijgen. In de loop der jaren ontwikkelde zich een aaneengesloten bebouwing van bedrijven en huizen in de directe omgeving. Het spoor is in 1974 opgeheven maar de bedrijventerreinen zijn nog altijd aanwezig en sterk uitgebreid.
Wat ook bleef was de woning van de halte-chef en de kleine loods, de grote loods en het station waren inmiddels afgebroken. Het huis heeft het uiterlijk van een herenhuis en staat met de nok haaks op de lijn van het oude spoor. Het pand heeft een zadeldak en er is veel siermetselwerk zowel binnen als in de buitengevels aanwezig. De eindgevels zijn tuitgevels met schouderstukken. De indeling van het huis, de stucplafonds, de aankleding en inrichting zijn gespaard gebleven. In de loods bevonden zich de stationstoiletten en opslagruimte.
In de mobilisatie werd de loods gebruikt als slaapplaats voor Nederlandse militairen die aan de Grebbelinie werkten. De aanwezige muurtekeningen herinneren hier nog aan. Naast de architectonische waarde heeft het complex ook stedenbouwkundige en cultuurhistorische waarde. Het werd dan ook door velen toegejuicht dat er in 2021 plannen werden gemaakt het geheel te renoveren. Welkoop Woudenberg kocht de nabij gelegen grond om een nieuwe winkel te bouwen en nam de verplichting op zich de voormalige woning en de loods te restaureren. Het huis en de loods zijn in 2024 gerestaureerd en het geheel is met succes geïntegreerd in de nieuwe winkel van Welkoop. Een mooi voorbeeld dat economie en cultuurhistorie samen kunnen gaan. Een extra historisch accent: Welkoop Woudenberg is een dochteronderneming van coöperatie AgruniekRijnvallei, de rechtsopvolger van de vroegere coöperatie Woudenberg- Maarn die zich in 1931 vestigde aan de spoorlijn Amersfoort- Kesteren. De maalderij van de Cooperatie was al sinds 1914 aan het spoor gevestigd.
In de mobilisatieperiode is het station gebruikt voor de aanvoer van soldaten naar de Grebbelinie, maar ook in de meidagen van 1940 voor de evacuatie van de Scherpenzeelse en Woudenbergse bevolking.